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瀕危穿山甲基因組解碼:保育新希望

由廣東省林業科學研究院、東北林業大學及其合作團隊,成功完成了兩種極度瀕危穿山甲物種的染色體級基因組組裝,分別是中華穿山甲(Manis pentadactyla)和馬來穿山甲(Manis javanica)。

穿山甲被譽為「活化石」,擁有許多獨特的生物特徵,例如覆蓋全身的角質鱗片、特殊的飲食習慣、長而強健的舌頭、敏銳的嗅覺系統以及掘洞能力。然而,在其分佈區域,當地人長期以來將其鱗片和肉用於藥材和食物,導致過度捕獵。

由於對奢華食品和中藥材的需求激增,穿山甲被推向滅絕邊緣。目前,穿山甲是全球非法交易最猖獗的野生動物,過去二十年間超過90萬隻被捕獵,涉及六大洲的67個國家。其中,亞洲穿山甲的非法捕獵情況尤為嚴重,特別是馬來穿山甲和中華穿山甲,因大規模捕獵和非法交易而面臨極大的生存壓力。自2014年起,這兩種穿山甲已被列入IUCN紅色名錄中的「極度瀕危」物種。

廣東省林業科學研究院的研究員嚴華及其團隊表示:「在2月15日世界穿山甲日之際,這項提供高品質基因組資料的研究,將有助於揭示馬來和中華穿山甲的基因脆弱性及滅絕風險。」

研究團隊首先以遠高於現有資料的解析度,完成了中華穿山甲和馬來穿山甲的基因組定序。這種近乎無間隙的染色體級基因組資料,對於評估物種的遺傳健康狀況和滅絕風險至關重要。研究包括遺傳多樣性估算,這能反映族群中個體間的遺傳變異程度。

科學家們以這些高品質資料為參考,結合先前發表的37隻中華穿山甲和72隻馬來穿山甲的基因組資料,重新評估了五個穿山甲族群的保育遺傳狀況。結果顯示,整體遺傳多樣性出乎意料地高,這對族群的遺傳健康來說是一個積極訊號。然而,細緻分析表明,某些族群的滅絕風險遠高於其他族群。

具體而言,根據其中一個穿山甲族群的基因資料,研究人員發現該族群在過去一萬年內經歷了比其他族群更快速且劇烈的數量下降。此外,其他遺傳引數也顯示該族群面臨極高的滅絕風險。研究團隊對來自臺灣的穿山甲樣本進行分析後,也發現了類似的令人擔憂的資料。

未來的研究需要進一步確認特定穿山甲族群因嚴重生存壓力而面臨的滅絕風險程度。資料還表明,應更加關注這些族群分佈區域間的差異,因為這些差異有助於指導正在進行的基因救援工作。

廣東省林業科學研究院和東北林業大學的研究員藍天明教授表示:「除了加強打擊非法捕獵和交易外,中國政府已建立保育中心,專門保護中華穿山甲和馬來穿山甲,並開發了人工繁殖計劃。藉助這些資料,我們能更好地評估野生族群的基因救援策略,未來可透過野化並釋放圈養個體來實現保育目標。」

這項研究成果已發表於《GigaScience》期刊,詳見論文。

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Tianming Lan et al. 2025. Enhancing inbreeding estimation and global conservation insights through chromosome-level assemblies of the Chinese and Malayan pangolin. GigaScience 14: giaf003; doi: 10.1093/gigascience/giaf003