研究發現：海南島茶樹是獨特的茶種變異品系

茶（學名：Camellia sinensis），三千多年前發源於中國，從一味草藥逐漸演變成廣受歡迎的飲品。儘管不少研究聚焦在中國西南地區的茶樹，但海南島的茶樹卻鮮少受到關注。海南茶與阿薩姆茶（Camellia sinensis var. assamica）極為相似，再加上海南島獨特的地理和氣候條件，使得探究海南茶的相關研究困難重重。一項新研究彌補了這一空白，研究人員從海南收集了500份茶樹樣本，運用全基因組重測序技術，探究海南茶與栽培茶種之間的差異。

郭等人確認了海南茶在茶種（Camellia sinensis）中的獨特分類地位，為資源保育和分子育種提供了寶貴見解。圖片出處：Lin2015。

茶是中國有史可考最早的樹木作物，馴化歷史超過三千年。

茶最初作為草藥使用，其歷史可追溯至近五千年前，後來才演變成廣為人們喜愛的飲品。

在全球範圍內，栽培茶樹主要分為兩大類：中國種（Camellia sinensis var. sinensis）和阿薩姆種（Camellia sinensis var. assamica） 。

海南島位於南海北部，茶樹種植歷史悠久，種植面積廣闊。

清朝末年就有關於海南島茶樹資源豐富的記載。

例如，美國傳教士兼植物學家亨利（Benjamin Couch Henry）在深入探訪海南黎族聚居區時，發現了大量野生茶樹，證實了海南島古茶樹資源的豐富。

由於雲貴高原被普遍認為是茶的可能起源地，大多數茶樹種群基因組學研究的樣本都來自中國西南地區，尤其是阿薩姆茶品種，使得海南島茶樹的研究相對匱乏。

「我們的研究釐清了海南茶的分類地位，強調了保育和分子育種工作的重要性。」 雲南農業大學研究員郭大中及其同事表示。

在這項研究中，作者對從海南四大產茶區（樂東、瓊中、白沙和五指山）收集的500份茶樹樣本（包括古茶樹樣本）進行了基因組測序。

他們共獲得6.9TB的原始測序資料，經過過濾和與參考基因組（雲抗10號）比對，最終平均比對率達到98.98%。

在變異檢測後，共鑑定出32,334,340個單核苷酸多型性（SNP），其中大多數位於基因間區域，少部分位於外顯子區域。

利用SNP資料進行的系統發育分析顯示，海南茶樣本形成了一個獨特的類群，與全球的中國種和阿薩姆種茶樹分開。在黎母山地區有明顯的地理聚集性，但在其他地區則無明顯規律。

種群結構分析進一步證實，與全球品種相比，海南茶具有獨特的遺傳組成。

主成分分析（PCA）也支援了這些發現，表明海南茶在遺傳上與中國種和阿薩姆種茶樹不同，儘管它與全球阿薩姆種茶樹有一些遺傳相似性。

此外，基因流分析表明，海南茶與其他茶品種之間的歷史遷移有限，進一步證明瞭其獨特的遺傳血統。

親緣關係分析表明，某些海南茶樣本中觀察到的密切遺傳關係，受到人工管理茶園中人力活動的影響。

遺傳多樣性分析顯示，海南和黎母山種群的多樣性水平高於中國種和阿薩姆種茶樹，海南茶和黎母山茶之間的遺傳分化極小。

這些結果凸顯了海南茶獨特的演化歷程，為其遺傳背景提供了寶貴見解，也為保育和育種策略提供了重要啟示。

海南茶的遺傳獨特性和高多樣性，凸顯了它作為未來育種計劃寶貴資源的潛力。

「我們的研究讓人們對茶種（Camellia sinensis）的演化有了更深入的理解，也為進一步研究海南非凡植物生命的遺傳基礎奠定了基礎。」研究人員表示。

他們的論文發表在《農業生物多樣性》期刊上。

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郭大中等人 2024年。基因組重測序揭示了一個獨立起源的茶種變異品系——海南茶。《農業生物多樣性》1（1）：3 - 12；doi: 10.48130/abd - 0024 - 0003