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AI結合顯微技術 首度繪製人類細胞超精細地圖

科學家首次運用先進顯微技術與AI工具如GPT-4,成功繪製出人類細胞的互動式地圖,揭露數千種蛋白質如何組織與協同運作。這項突破性研究不僅發現數百種未知蛋白質功能,更鎖定與兒童骨癌相關的關鍵細胞結構,將徹底改變我們研究細胞生物學與疾病機制的視角。

自400多年前顯微鏡問世以來,科學家便致力於解析細胞奧秘。加州大學聖地牙哥分校博士後研究員Leah Schaffer指出:「雖然我們知道細胞記憶體在哪些蛋白質,但對它們如何組裝並執行細胞功能,至今仍知之甚少。」這項由美加頂尖團隊合作的研究,特別聚焦與兒童骨腫瘤相關的U2OS細胞,透過高解析度顯微鏡與蛋白質互動作用資料的整合,首度完整呈現細胞內蛋白質的空間組織。

研究共同資深作者Trey Ideker教授比喻:「就像組裝精密儀器,我們過去只有零散的零件清單,現在終於獲得完整的裝配手冊。」團隊運用親和純化技術分離單一蛋白質,並分析超過2萬張螢游標記的細胞內部影像,最終繪製出5,100多種蛋白質形成的275個獨特組裝結構。

史丹佛大學Emma Lundberg教授強調:「傳統『一基因一蛋白一功能』的觀念已被顛覆。」研究發現975種蛋白質的新功能,例如原本功能未知的C18orf21蛋白竟參與RNA處理,而DPP9蛋白則與對抗感染的幹擾素訊號有關。這些發現得益於GPT-4的協助,它能快速分析科學文獻,提出蛋白質組裝的命名與功能假設,大幅加速研究程序。

這幅細胞地圖如同Google地圖般可自由縮放瀏覽,研究者能清楚觀察各蛋白質群落的分佈位置。透過定位突變蛋白,團隊更發現21個與兒童癌症高度相關的蛋白質組裝,其中102種突變蛋白被證實直接參與癌化過程。Ideker教授指出:「與其追蹤罕見的單一突變,更應關注被突變破壞的細胞共同運作機制。」

發表於《自然》期刊的這項研究,不僅為兒童癌症研究開闢新徑,更建立其他細胞型別圖譜的繪製範本。未來科學家可運用AI工具,進一步解密各種疾病背後的分子機制,開啟精準醫療新紀元。