珍稀斑點手魚基因組成功解碼

澳洲聯邦科學與工業研究組織（CSIRO）的研究團隊，成功解碼了斑點手魚（學名：Brachionichthys hirsutus）的基因組。斑點手魚是一種瀕臨絕種的海洋魚類，為塔斯馬尼亞島的特有物種。

斑點手魚（Brachionichthys hirsutus）是手魚科（Brachionichthyidae）中一種罕見的底棲魚類。

這種獨特的魚類僅棲息於塔斯馬尼亞州的德文特河河口及其附近海域，通常生活在水深5至10公尺（16至33英尺）的地方。

斑點手魚於1804年首次被正式描述，其胸鰭高度特化，看起來就像一雙手，使其能夠在海底「行走」。

斑點手魚的食物包括小型貝類、蝦類和多毛類蠕蟲。

在《世界自然保護聯盟瀕危物種紅色名錄2020》中，斑點手魚被列為「極度瀕危」物種。科學家估計，目前野外僅存不到2000隻個體。

其種群數量的迅速下降，歸因於過去的捕撈活動、沿海開發、氣候變化以及外來入侵物種的到來。

CSIRO的研究人員Gunjan Pandey表示：「基因組序列將有助於現有的保育工作，增加斑點手魚的種群數量，並監測其遺傳多樣性。」

「基因組能幫助我們瞭解生物的運作機制。」

「它為研究生物日常生活中的基因表達提供了基礎，也讓我們對其演化歷史有更深入的瞭解。」

「有了基因組，我們可以協助物種偵測、監測種群，甚至估算斑點手魚的壽命。」

CSIRO的另一位研究人員Carlie Devine補充道：「這些豐富的遺傳資訊，將為長期的保育策略提供重要的參考。」

「保育措施正逐漸擴充套件到遺傳學領域，我們意識到，除了生態學研究外，多學科的研究方法對於有效保育瀕危物種至關重要。」

「像斑點手魚這樣的海洋物種，研究起來非常困難。」

「它們的DNA降解速度很快，而且容易受到微生物的汙染。」

「這使得組裝出純淨的基因組極具挑戰性。」

研究團隊利用所謂的「低起始量方案」，從少量低質量的DNA中成功測序出完整的基因組。

Pandey博士表示：「全球只有三個研究團隊在使用這種方案，我們是其中之一。」

「從實驗室的設定到生物資訊學軟體，整個過程都是我們量身定製的，目的就是要從低質量的DNA中測序出高質量的基因組。」

「過去需要六到十二個月才能完成的工作，現在幾天就能完成。這項技術為我們瞭解和保育澳洲乃至全球的瀕危物種帶來了巨大的希望。」