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破解分子之謎:曾被視為「無用」的RNA片段竟助細胞對抗壓力

這項研究首次證實,某些tRNA內含子會影響基因表現。科學家發現,一些曾被視為「垃圾」的小RNA片段,實際上在調控信使RNA(mRNA)的生成以及幫助細胞應對氧化壓力方面扮演著重要角色。這些被稱為內含子的片段,是轉運RNA(tRNA)的一部分,而tRNA在將胺基酸組合成蛋白質的過程中至關重要。

傳統上,這些內含子被認為是無功能的,因為它們在tRNA參與蛋白質合成之前會被移除。然而,俄亥俄州立大學的一項新研究顯示,某些內含子會與將遺傳訊息轉譯成蛋白質的關鍵分子區域結合,觸發其降解,從而停止蛋白質的生成。在細胞暴露於氧化壓力的實驗中,一種內含子表現出異常的穩定性,這表明這些內含子可能是進化生存機制的一部分。

多年來,一些意外的觀察促使科學家們研究這些被稱為fitRNAs(tRNA遊離內含子)的功能:它們與其他RNA分子之間看似不可能的序列關係、細胞用來丟棄它們的多種方法,以及在壓力條件下某些內含子的過度表現。研究資深作者、俄亥俄州立大學分子遺傳學教授Anita Hopper表示:「沒有人預料到內含子會有功能。但對我來說,如果它們真的毫無功能,細胞卻有六種或更多不同的方式來摧毀它們,這根本說不通。」

這項研究最近發表在《分子細胞》(Molecular Cell)期刊上。tRNA與mRNA透過互補性合作來構建蛋白質,這意味著tRNA序列會與mRNA分子上的互補序列配對,以確保在蛋白質合成過程中新增正確的胺基酸。Hopper的團隊以酵母為研究模型,幾年前發現一些被切下的內含子序列與mRNA序列互補,這表明內含子可能在遺傳密碼的轉譯中具有重要性。

研究人員發現,一旦這些遊離的內含子與特定的mRNA結合,就會導致mRNA分解,從而阻止蛋白質的生成。實驗證實了這種明顯的反向關係:刪除或誘導fitRNAs的過度表現,分別會導致目標mRNA的增加或減少。第一作者、Hopper實驗室的博士後研究員Regina Nostramo指出,fitRNA的功能與微小RNA(microRNA)相似,但有一個顯著的區別:microRNA需要與Argonaute家族蛋白互動來降解mRNA,而在這種酵母中,由於沒有Argonaute蛋白,mRNA仍然會被降解,但機制不同。

Hopper進一步指出,microRNA總是附著在目標mRNA的非編碼種子區域,而遊離的內含子則會結合到mRNA的蛋白質編碼區域。這不僅是一種新發現的小非編碼RNA,而且它還以一種新穎的方式運作。研究人員認為,能夠抑制蛋白質生成的能力表明,內含子為細胞提供了優勢。

研究團隊將繼續透過讓細胞暴露於熱壓力、飢餓和其他挑戰性條件來探索fitRNAs的重要性。Hopper表示:「也許細胞在健康條件下對這些小內含子的需求很小,但在壓力下,當某些內含子變得穩定時,它們可能扮演著非常重要的角色。」

這項研究由美國國家衛生研究院(NIH)、Pelotonia本科生獎學金和俄亥俄州立大學本科生研究獎學金支援。